執行機関として大会、中央委員会の決議に従って業務の執行にあたります。

■中央執行委員会
最高決議機関であり、役員と大会代議員で構成されます。大会では「運動方針」「規約・規定の改廃」「決算および予算」「役員の選出」などが決定されます。
■中央委員会

大会に次ぐ決議機関であり、役員と中央委員で構成されます。中央委員会では「闘争方針および活動方針」「規程の改廃」「中間決算報告および予算の補正」「役員の辞任および補充」などが決定されます。

■大会

 JAMは1万人を超える単組も30人の単組もそれぞれが主役として、尊重して地方JAM、業種別部会、大手労組会議の3本柱の活動体制に参加し、大会をはじめとする各機関を民主的に運営。スケールメリットを活かした活動を展開しています。JAMは、少数意見も大切にする、「みんなが主役の産業別労働組合」です。
各地方JAMや加盟単組への的確な情報発信・支援・指導を行う本部には、約40名の専従者を配置し、地方・業種・大手を通じて展開される運動方針・闘争方針、調査活動や政策提言など、各種活動計画の立案にあたるなど、全国的な運動を推進しています。機関紙・誌が毎月発行されて活動内容が紹介されるほか、共済の給付事務等が処理されています。
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